Metabarcoding da região ITS por sequenciamento nanopore para caracterização de fungos em superfícies de ambiente industrial farmacêutico
Palavras-chave:
Nanopore, ITS, Fungos ambientais, Metabarcoding, Monitoramento microbiológico
Resumo
O monitoramento microbiológico de superfícies em ambientes industriais é essencial para a prevenção de contaminações e garantia da qualidade dos processos produtivos. Métodos convencionais baseados em cultivo apresentam limitações na recuperação e identificação de fungos ambientais, especialmente organismos de crescimento lento ou não cultiváveis. O metabarcoding da região ITS, associado ao sequenciamento de longa leitura, apresenta potencial para fornecer maior detalhamento taxonômico e caracterização mais abrangente da microbiota ambiental. O presente estudo avaliou a aplicação do sequenciamento por nanoporos para identificação de fungos em amostras de swab de ambiente industrial, utilizando a região ITS como marcador molecular. Foram analisadas 15 amostras de swab provenientes de superfícies industriais. O DNA total foi extraído, a região ITS amplificada por PCR e as bibliotecas preparadas para sequenciamento em plataforma Nanopore. As leituras obtidas foram submetidas a controle de qualidade e classificação taxonômica com base em bancos de dados de referência. O sequenciamento permitiu a identificação de uma comunidade fúngica diversa, com detecção consistente de múltiplos táxons em nível de gênero e espécie. Entre os gêneros mais frequentemente identificados destacaram-se Fusarium, Penicillium e Aspergillus. Entre as espécies identificadas observaram-se Fusarium graminearum, Fusarium oxysporum, Fusarium fujikuroi, Penicillium oxalicum e Aspergillus fumigatus. Observou-se variabilidade entre as amostras analisadas, indicando diferentes perfis microbiológicos entre as superfícies avaliadas. Os resultados obtidos sugerem que o sequenciamento Nanopore da região ITS representa uma ferramenta promissora para caracterização microbiológica ambiental em ambientes industriais, demonstrando potencial para ampliar a resolução taxonômica quando comparado a abordagens microbiológicas convencionais.Referências
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Publicado
2026-08-23
Como Citar
ROSINO, G. S.; CARVALHO, L. M. P. DO P. DE; SILVEIRA, N. C. A. DA. Metabarcoding da região ITS por sequenciamento nanopore para caracterização de fungos em superfícies de ambiente industrial farmacêutico. Revista Científica do UBM, v. 28, n. 55, p. 428-439, 23 ago. 2026.
Seção
Artigos
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