SGC para classificação taxonômica de uma cepa de Bacillus paranthracis isolada de uma indústria farmacêutica, identificada por MALDI-TOF MS como Bacillus spp.

Palavras-chave: SGC, Bacillus paranthracis, MLST, Taxonomia, Indústria farmacêutica

Resumo

A identificação microbiana acurada é necessária para o controle de contaminação durante a produção de medicamentos estéreis. Contudo, a identificação ao nível de espécie de Bacillus e gêneros relacionados permanece um desafio. Este estudo teve como objetivo caracterizar a cepa B0029.24, isolada de uma indústria de imunobiológicos no Rio de Janeiro, Brasil, previamente identificada no sistema MALDI Biotyper® como Bacillus cereus/thuringiensis (escore 1,7), e por sequenciamento do gene 16S rRNA como Bacillus sp. A caracterização genômica foi realizada por meio do sequenciamento do genoma completo (SGC) utilizando a plataforma Illumina NextSeq 2000. O SGC revelou um tamanho de genoma de 5.63 Mb, 93 contigs, N50=188620 pb, L50=8 e conteúdo GC de 35.14%. O Type Strain Genome Server classificou a cepa como Bacillus paranthracis, confirmado por ANIb (98,58%). No entanto, o valor de dDDH de 77,80% indica que o isolado representa uma provável nova subespécie. A completude e a contaminação foram estimadas em 99,07% e 0,39%, respectivamente, pelo CheckM2 utilizando a plataforma Galaxy. A cepa foi tipificada por Multilocus Sequence Typing (MLST) como ST-164 e por rMLST como rST69175, com B. paranthracis como o táxon previsto (100%). O genoma foi depositado no banco de dados do National Center for Biotechnology Information (NCBI) (nº de acesso JBVQSU000000000) e identificado pela ferramenta de taxonomia do NCBI como B. paranthracis (TaxID 2026186). Após a confirmação genômica, foi gerado o Main Spectrum Profile (MSP), contribuindo para a ampliação do banco de dados do MALDI Biotyper®. Conclui-se que a integração da genômica com a espectrometria de massas é uma estratégia eficaz para uma identificação microbiana rápida e acurada, permitindo decisões mais assertivas na estratégia de controle de contaminação.

Biografia do Autor

Paula Araujo de Souza, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Juliana Nunes Ramos, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Ana Beatriz Lima dos Santos Tiburcio, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Ana Luiza Sant’ana da Silva Guimaraes, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Talita Bernardo Valadão, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Rebeca Vitória da Silva Lage de Miranda, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Andressa Sbano da Silva Ferreira, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Luciana Veloso da Costa, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Marcelo Luiz Lima Brandão, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, RJ

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Publicado
2026-08-23
Como Citar
SOUZA, P. A. DE; RAMOS, J. N.; TIBURCIO, A. B. L. DOS S.; GUIMARAES, A. L. S. DA S.; VALADÃO, T. B.; MIRANDA, R. V. DA S. L. DE; FERREIRA, A. S. DA S.; COSTA, L. V. DA; BRANDÃO, M. L. L. SGC para classificação taxonômica de uma cepa de Bacillus paranthracis isolada de uma indústria farmacêutica, identificada por MALDI-TOF MS como Bacillus spp. Revista Científica do UBM, v. 28, n. 55, p. 440-457, 23 ago. 2026.
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